| 1 | Parque Nacional de Doñana |
17 | Prat de Cabanes-Torreblanca |
33 | Mar Menor |
| 2 | Parque Nacional las Tablas de Daimiel |
18 | Aiguamolls de l'Emporda |
34 | Marismas de Santoña, Victoria y Joyel |
| 3 | Laguna de Fuentedepiedra |
19 | Delta del Ebro |
35 | Marjal de Pego-Oliva |
| 4 | Lagunas de Cádiz: Laguna de Medina y Laguna Salada |
20 | Laguna de Manjavacas |
36 | Lagunas de Laguardia: Carralogroño,Carravalseca, Prao de Paul y Musco |
| 5 | Lagunas del sur de Córdoba: Zóñar, Rincón y Amarga |
21 | Lagunas de Alcázar de San Juan (Yeguas y Camino de Villafranca) |
37 | Embalse de las Cañas |
| 6 | Marismas del Odiel |
22 | Laguna del Prado |
38 | Laguna de Pitillas |
| 7 | Salinas del Cabo de Gata |
23 | Embalse de Orellana |
39 | Txingudi |
| 8 | Albufera de Mallorca |
24 | Complejo de las playas, dunas y lagunas de Corrubedo |
40 | Salburua |
| 9 | Laguna de la Vega o del Pueblo |
25 | Laguna y arenal de Valdoviño |
41 | Colas del embalse de Ullibarri-Gamboa |
| 10 | Lagunas de Villafáfila |
26 | Ría de Mundaka.Guernica |
42 | Lago de Caicedo-Yuso y Salinas de Añana |
| 11 | Complejo intermareal Umia-Grove, La Lanzada, Punta Carreirón y Lago Bodeira |
27 | Salinas de Ibiza y Formentera |
43 | Saladar de Jandía |
| 12 | Rías de Ortigueira y Ladrido |
28 | Salada de Chiprana |
44 | Laguna de La Nava de Fuentes |
| 13 | Albufera de Valencia |
29 | Laguna de Gallocanta |
45 | Bahía de Cádiz |
| 14 | Pantano de El Hondo |
30 | Embalses de Cordobilla y Malpasillo |
46 | Lago de Banyoles |
| 15 | Salinas de La Mata y Torrevieja |
31 | Albufera de Adra |
47 | Laguna de El Hito |
| 16 | Salinas de Santa Pola |
32 | Ría del Eo o Ribadeo |
48 | Lagunas de Puebla de Beleña |
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49 | Complejo lagunar de la Albuera |